将安全设施投资纳入项目决算，实际上是需要明确安全设施投资的合理归类与财务处理方式。根据相关法规和政策，安全设施投资应当纳入建设项目概算而非决算。以下是将安全设施投资纳入项目概算的具体操作方法：

明确安全设施投资的范围

安全设施投资包括用于预防生产安全事故的设备、设施、装置、构（建）筑物及其他技术措施的费用。这些投资需与主体工程同时设计、同时施工、同时投入生产和使用，即遵循“三同时”原则。

在项目设计阶段纳入概算

建设项目的设计单位在编制投资计划文件时，应同步编制安全设施的设计文件，并将安全设施投资纳入项目概算。概算需详细列出安全设施的预计费用，确保其符合国家或行业标准。

同步施工与验收

施工单位应严格按照安全设施的设计图纸和要求进行施工，确保安全设施与主体工程同步施工。在项目竣工验收时，安全设施也需同步验收，验收合格后方可投入使用。

财务处理与费用入账

安全设施投资的财务处理应遵循企业会计准则。相关费用在项目实施过程中逐步入账，计入固定资产或在建工程成本。财务部门需建立安全费用台账，保存期不少于3年。

监督与管理

安全生产监督管理部门将对建设项目的安全设施“三同时”实施监督管理。企业需确保安全设施投资的落实，并接受相关部门的监督检查。

通过以上措施，企业可以确保安全设施投资合理纳入项目概算，保障项目建设的安全性和合规性。